Ensiklopedia Nahdlatul Ulama : sejarah, tokoh, dan khazanah pesantren
Hadis qudsi : firman Allah yang tidak dicantumkan dalam Al-Qur'an pola pembinaan akhlak muslim
Menegakkan pluralisme : fundamentalisme-konservatif di tubuh Muhammadiyah (esai-esai pemikiran Moh. Shofan daj refleksi kritis kaum pluralis)
Neonatologi: Buku ajar
Kiai mengaji santri acungkan jari : refleksi kritis atas tradisi dan pemikiran pesantren